生物发酵罐的种类很多，如机械搅拌式发酵罐、鼓泡发酵罐、液体循环式发酵罐等。
1、机械搅拌式发酵罐
可分为通风式发酵罐、自吸式发酵罐等。机械搅拌通风发酵罐是发酵设备中常用的一种类型。机械搅拌通风发酵罐是一种密封压力设备，主要由罐体、轴封、消泡剂、搅拌器、联轴器、中间轴承、挡板、供气管、换热器、井筒、管道等组成。
（1）通风发酵罐：通风发酵罐被称为通用发酵罐，是工业上常用的微生物反应器。其优点是发酵液的pH值和温度容易控制，适合于连续培养。其缺点是在丝状菌的培养过程中，细胞容易被破坏。
（2）自吸式发酵机不需要空气压缩机来供应压缩空气。自吸式发酵机利用搅拌器产生的负压来吸进空气。其优点是搅拌和供气都由机械搅拌器完成。缺点是吸气范围不大，对无菌要求高的发酵不适合，因为空气在搅拌时进入发酵机，不适合厌氧发酵。
2、鼓泡发酵罐
鼓泡生物发酵罐借助于气泡空气提供搅拌和传质所需的动力。鼓泡发酵罐具有结构简单、成本低、耗电少等优点，减少了丝状菌培养的危害。鼓泡发酵罐一般适用于低粘度、低固体含量、低耗氧量的发酵过程。
3、液体循环发酵罐
液体循环发酵罐有两种：气升式发酵罐和喷嘴环式发酵罐。
（1）气升式发酵罐：气提发酵罐与气泡发酵类似，没有机械搅拌，但罐外安装有外循环管道。气举发酵罐具有结构简单、成本低、能耗低等优点。榉木发酵罐一般适用于低粘度、低固体含量的介质。
（2）喷嘴循环发酵罐：喷嘴循环生物发酵罐利用机械泵排出压缩空气，在喷嘴处形成剪切力场，将注入的空气分散成液相中的小气泡。与空气提升发酵罐相比，喷嘴环形发酵罐的适用范围更广。
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